Da, v hudih in dolgotrajnih primerih hipotiroidizma lahko ščitnica sčasoma popolnoma preneha delovati, kar povzroči stanje, imenovano primarni hipotiroidizem. To se zgodi, ko ščitnica sama ne proizvaja dovolj ščitničnih hormonov, kljub prisotnosti ustreznega ščitničnega stimulirajočega hormona (TSH) iz hipofize. Če se hipotiroidizem ne zdravi ali je slabo nadzorovan, lahko povzroči resne zdravstvene zaplete in sčasoma popolno odpoved ščitnice. Zato je za posameznike s hipotiroidizmom ključnega pomena, da prejmejo ustrezno zdravljenje in redno spremljanje, da preprečijo napredovanje v to stopnjo.