Čeprav lahko številni virusi povzročijo bolezni, obstajajo tudi nekateri virusi, ki imajo lahko koristne učinke. Nekateri virusi lahko na primer pomagajo nadzorovati populacije škodljivih žuželk, druge pa lahko uporabimo za ustvarjanje cepiv. Poseben primer dobrega virusa je bakteriofag, ki je virus, ki okuži in ubije bakterije. Bakteriofagi se lahko uporabljajo za zdravljenje bakterijskih okužb, kot so tiste, ki jih povzročata E. coli ali Salmonella. Še posebej so koristni v primerih, ko antibiotiki niso učinkoviti. Bakteriofagi se uspešno uporabljajo v humani in veterinarski medicini, njihova prednost pa je, da lahko ciljajo na določene vrste bakterij, ne da bi poškodovali druge koristne bakterije v telesu.