Cistektomija je kirurški poseg za popolno odstranitev mehurja. To operacijo običajno izvedemo, ko je mehur nepopravljivo poškodovan, na primer zaradi raka ali drugih bolezni, in ko so bila druga zdravljenja neuspešna. V teh primerih bo morda potrebna cistektomija, da se odstrani vse rakasto tkivo in prepreči širjenje raka. Poleg tega se cistektomija lahko izvede v primerih hude inkontinence (izguba nadzora nad mehurjem), ki je ni mogoče obvladati z drugimi metodami.