Filtrirne igle so predmeti za enkratno uporabo in jih je treba po vsaki uporabi zavreči. Ponovna uporaba filtrirnih igel lahko vnese onesnaževalce in poveča tveganje okužbe ali navzkrižne kontaminacije vzorcev. Poleg tega lahko ponovna uporaba igel poškoduje filter in vpliva na natančnost postopka filtracije. Zaradi teh razlogov je pomembno, da za vsak postopek filtracije vedno uporabite novo filtrsko iglo.