Da, amigdala je del limbičnega sistema. Limbični sistem je kompleksna mreža možganskih struktur, ki se nahajajo globoko v možganih, vključno z amigdalo, hipokampusom, hipotalamusom in cingulatno skorjo. Te strukture sodelujejo pri uravnavanju čustev, spomina, motivacije in vedenja. Natančneje, amigdala je mandljeva masa jeder, ki je vključena v procesiranje čustev, zlasti strahu in agresije. Sodeluje tudi pri oblikovanju in shranjevanju spominov, povezanih z močnimi čustvenimi izkušnjami.