Eden najresnejših zdravstvenih problemov v Afriki je visoka razširjenost virusa HIV/aidsa, ki je še vedno velik izziv. Podsaharska Afrika je regija, ki jo je epidemija najbolj prizadela, saj leta 2021 po ocenah 25,6 milijona ljudi živi z virusom HIV. Stopnja novih okužb in število smrti, povezanih z aidsom, ostajata visoka, zlasti med ranljivimi skupinami, kot so ženske, dekleta , in moških, ki imajo spolne odnose z moškimi. Pomanjkanje dostopa do cenovno dostopnih in učinkovitih storitev zdravljenja in preprečevanja, stigma in diskriminacija so nekatere od ovir pri spopadanju z epidemijo.