Obstaja več kot 200 podtipov humanega papiloma virusa (HPV). Različni podtipi HPV so povezani z različnimi zdravstvenimi stanji. Nekateri podtipi, kot sta HPV-16 in HPV-18, veljajo za visokorizične in so povezani z rakom materničnega vratu, vulve, nožnice, analnega in orofaringealnega raka. Drugi podtipi, kot sta HPV-6 in HPV-11, veljajo za nizko tveganje in so povezani z genitalnimi bradavicami.