Antibiotiki niso vedno rešitev za zdravljenje bolezni. Čeprav so antibiotiki lahko učinkoviti pri zdravljenju nekaterih okužb, ki jih povzročajo bakterije, niso učinkoviti proti virusnim okužbam, kot sta prehlad ali gripa. Poleg tega imajo lahko antibiotiki neželene učinke in lahko porušijo normalno bakterijsko ravnovesje v telesu, kar povzroči težave, kot je odpornost na antibiotike. V primerih nebakterijskih okužb antibiotiki verjetno ne bodo pomagali. Pomembno je, da usposobljen zdravstveni delavec pravilno diagnosticira vzrok bolezni in po potrebi predpiše ustrezno zdravljenje.