Endokrini sistem tesno sodeluje z reproduktivnim sistemom pri uravnavanju spolnega razvoja, menstrualnih ciklov, nosečnosti in menopavze. Hipotalamus in hipofiza, ki sproščata hormone, igrata ključno vlogo pri nadzoru sproščanja drugih reproduktivnih hormonov, vključno z estrogenom, progesteronom, testosteronom in folikli.