Na kromosomih ni specifične lokacije, kjer se nahaja Crohnova bolezen. Crohnova bolezen je kompleksna genetska motnja, ki je posledica interakcij med številnimi genetskimi variacijami in okoljskimi dejavniki. Čeprav je bilo identificiranih več genetskih variant, povezanih s Crohnovo boleznijo, so razpršene po različnih kromosomih.