Zaporedne Chip Protokoli

Zaporedna kromatin imunoprecipitacije , znan kot SeqChIP , jebiološki preskus je namenjen opredeliti načine, na katere sta proteini interakcijo v eni regiji deoksiribonukleinske kisline ( DNK ) sklop . Raziskovalci sodelujejo poseben sklop naročenih nalog, ki razkrivajo tri možne odnose med beljakovinami , ki se ocenjuje . Kot pri večini testov znanosti , da bitja s čiščenjem in se konča s sklenitvijo . V skladu s Harvarda raziskovalcev lahko tehnološki napredek v analizi SeqChIP omogočajo znanstvenikom, da širše študij biološke pojave . Pripravite

SeqChIP poskusi vsebuje skrbno pripraviti , da bi razkužila in čiščenje magnetne kroglice za eksperiment. Raziskovalci morajo oprati biserom, večkrat in jih očistite v " bloku " rešitev. Kroglice so nato prekinjena za sušenje in ponovno oprati - . Na splošno so znanstveniki pustite dan pred končno pranje , preden napreduje na stopnjo povezovanja . Glede na naravo različne sklope DNK za oceno , ta faza priprav se razlikuje tudi v kompleksnosti. Vendar pa je ena znanstvena resnica ostaja:čistilotest,čistejšerezultat
križnih vezi

Znanstveniki izberite proteinskih kompleksov DNA ali območja v sklop , za dodatno opremo. s protitelesom . V bistvu , biologi avo beljakovine , da bi opazovali njihove interakcije. Ko je opaziti , potrebuje cross -link bo potrjen v obratnem vrstnem redu . Ali proteini še vedno povezana , ko sezaporedje obrne ? SeqChIP znanstveniki verjamejo, dasoobstoj obeh proteinov , ko ocenjujejo v nasprotni smeri zagotoviti prepričljive dokaze o popolnem sodelovanju zasedenosti , in dovoljuje nedvoumno razlikovanje delne zasedenosti in brez sodelovanja zasedenosti.

Purify

verižno reakcijo s polimerazo , ali " PCR" jepostopek DNA - pomnoževanje , ki preverja kakovost, ali čistost, DNA . PCR poteka v treh fazah . Prvič, PCR topi pramenov narazen z dvigom temperature . Potem , raziskovalci prinesel dve predloge pramene nazaj skupaj s PCR primerji . Končno, biologi inkubiramo DNK polimeraza , tako da primerji povzroči rubriki preiskavo , da bi združil . Od tam , raziskovalci prosto gibajo na preiskavo grozdov .
Ocenite

Analiza preučuje DNK verig na prisotnost ali odsotnost " zasedenosti " interaktivnega odnosa med beljakovin. Dve beljakovine, ki vedno povezujejo z enakim fragmentom DNA imajo popolno sodelovanje zasedenost , co - zasedenost se pojavi, ko se lahko proteini povezujejo le v obojestransko ekskluzivne sub- populacije DNA sklopa; delno sofinancira zasedenost pomeni, da imajo nekatere molekule DNA , tako beljakovine , medtem ko imajo eno alidrugo. Če testiranje SeqChIP je en postopek v sklopu biologije , zagotavlja znanstvenikom z možnostjo uporabe v ednini rezultate za celotno genomsko strukturo .