Primarna molekula, ki jo odstranijo pljuča, je ogljikov dioksid (CO2). Ogljikov dioksid je odpadni produkt celičnega dihanja in se s krvnim obtokom prenaša iz tkiv v pljuča. Ko pride CO2 v pljuča, se med procesom dihanja izdiha v ozračje. Pljuča imajo ključno vlogo pri uravnavanju ravni ogljikovega dioksida v krvnem obtoku, vzdrževanju kislinsko-bazičnega ravnovesja telesa in zagotavljanju pravilnega delovanja različnih fizioloških sistemov.