Prvi izbruh virusa ebole se je zgodil leta 1976 v današnji Demokratični republiki Kongo (nekdanji Zair). Do izbruha je prišlo v vasi blizu reke Ebola, po kateri je virus dobil ime. Drugi izbruh se je zgodil v današnjem Južnem Sudanu, prav tako leta 1976. Od takrat je bilo v Afriki več izbruhov bolezni z virusom ebole.