Kako spremeniti zaporedje na FASTA

En skupen cilj pri medicinskih raziskavah vključuje prepoznavanje napak ali mutacij v zaporedju DNK , ki lahko povzročijo genetske bolezni. Tehnologije in računalništva so napredne genetske raziskave na raven, kjer se lahko preskuša hkrati več tisoč podatkov zaporedju . Ena Določba novejšo programsko opremo, je pred pretvorbo podatkov o zaporedju v formatu FASTA . FASTA je podobna preprosti besedilni obliki. To omogoča več kosov podatkov, ki jih je treba zbrati v eno datoteko in pospešuje analizo. Vendar pa je večina instrumentov ustvari zaporedje datotek v besedilni obliki. Pretvarjanje besedila v formatu FASTA jepreprost postopek, ki uporablja urejevalnik besedila programske opreme. Tisto, kar potrebujete
računalnika
programa urejevalnik besedila
Proste Prikaži več navodil

1

Odprite določeno zaporedje DNA, besedilno datoteko z besedilom , program za urejanje . To bi bilo Text Editor za Macintosh in si zapomnite Pad združljive sisteme Windows. Original zaporedje tekstovne datoteke, bi lahko alternativno končnico kot zap po podatkih , pridobljenih na Applied Biosystems avtomatskega genskega analizatorja .
2

Začnite prvo vrstico s tipkanjem> sledi identifikator sekvence . Večja kot simbol označuje obliko FASTA za programe , ki analizirajo množice med podatke. Ni posebnih pravil v zvezi z identifikacijo , dokler ni presledkov . Primer sprejemljivega vnosa v prvi liniji> Cat_Isomerase_Exon3 .
3

pritisnite tipko "Nazaj " ustvariti prelom vrstice in začeti drugo vrstico .

4

Začnite podatke o zaporedjih na liniji . Smernice FASTA format zahtevajo besedilne DNK podatkov naslednje Mednarodne zveze za čisto in uporabno kemijo IUPAC kode . Vsaka vrstica je omejena na 80 znakov , ki predstavljajo 80 baz DNK in so lahko velike ali male črke . Sprejemljiv vnos vključno mešanih podlag AGCTTCGTGG ... CVTGCGTTGT .
5

pritisnite tipko "Nazaj " za začetek naslednje vrstice podatkov zaporedju . Vsaka vrstica mora biti sestavljen iz 80 baz z oznako IUPAC zastopane .
6

Shranite datoteko z uporabo podaljšek txt datoteke ali podaljšek FASTA datoteke. Programi, ki obdelujejo FASTA formatiranih podatkov pogosto zahtevajo množice med določenimi končnicami , kot so finančne storitve , FNA , ffn ali FRN .