Pri postopku stožčaste biopsije je bolnik običajno nameščen v litotomski položaj. To vključuje ležanje na hrbtu s pokrčenimi nogami in nameščenimi v stremenih, ki omogočajo dostop do reproduktivnih organov. Bolnika lahko tudi prosimo, naj izprazni mehur, da zagotovi boljšo vizualizacijo med postopkom.