Del možganov, ki je prizadet zaradi epilepsije, je odvisen od vrste napada in osnovnega vzroka. Na splošno so napadi posledica nenormalne električne aktivnosti v možganih. Ta aktivnost se lahko pojavi v katerem koli delu možganov, vendar se najpogosteje začne v temporalnih režnjih, ki se nahajajo na straneh možganov. Pri epilepsiji temporalnega režnja lahko napadi povzročijo različne simptome, vključno s spremembami razpoloženja, vedenja in spomina. Drugi deli možganov, ki jih lahko prizadene epilepsija, so čelni režnji, parietalni režnji in okcipitalni režnji. Napadi, ki se začnejo v čelnih režnjih, lahko povzročijo spremembe osebnosti, vedenja in gibanja. Napadi, ki se začnejo v temenskih režnjih, lahko povzročijo težave z jezikom, prostorskim zavedanjem in pozornostjo. Napadi, ki se začnejo v okcipitalnih režnjih, lahko povzročijo motnje vida.