Ko B-limfociti ostanejo v prebavnem traktu, se lahko diferencirajo v plazemske celice, ki proizvajajo protitelesa. Ta protitelesa se lahko vežejo na antigene v prebavnem traktu, kot so tista, ki jih najdemo na bakterijah ali delcih hrane. Ta vezava lahko povzroči aktivacijo imunskega sistema, kar povzroči vnetje in poškodbe prebavnega trakta. To stanje je znano kot vnetna črevesna bolezen (KVČB).