Vsi antigeni niso imunogeni. Imunogen je antigen, ki je sposoben spodbuditi imunski odziv, medtem ko je antigen vsaka snov, ki jo imunski sistem prepozna. Nekateri antigeni niso imunogeni, bodisi zato, ker jih imunski sistem ne more obdelati, bodisi zato, ker ne vsebujejo potrebnih molekularnih struktur za sprožitev imunskega odziva. Na primer, nekateri polisaharidi so antigeni, vendar niso imunogeni, medtem ko so nekateri proteini hkrati antigeni in imunogeni.