Dejanska izmenjava plinov v dihalnem sistemu poteka v alveolih, ki so drobni zračni mešički v pljučih. Alveoli so obloženi s kapilarami, ki so drobne krvne žilice. Kisik iz zraka difundira skozi alveole in v kapilare, medtem ko ogljikov dioksid difundira iz kapilar v alveole. S kisikom bogato kri srce nato črpa v preostali del telesa, medtem ko se kri, bogata z ogljikovim dioksidom, črpa v pljuča, da jo izdihne.