Bolezni rok, nog in ust ne povzročajo bakterije, temveč virusi. Natančneje, povzroča ga več sevov coxsackievirusa, ki je vrsta enterovirusa. Ti virusi vstopajo v telo skozi usta ali dihala in se nato razmnožujejo v prebavilih in grlu. Okužba se običajno širi prek tesnega stika z nekom, ki je že okužen, pogosto prek telesnih tekočin, kot je slina ali tekočina iz mehurjev na rokah in nogah.