Mišice, ki jih prizadene sindrom karpalnega kanala, so longus flexor pollicis, superficialis flexor digitorum, profundus flexor digitorum in longus abductor pollicis. Te mišice so odgovorne za upogibanje prstov, palca in zapestja. Ko je mediani živec stisnjen v karpalnem kanalu, lahko te mišice oslabijo in atrofirajo. To lahko povzroči težave pri prijemanju predmetov, pisanju in opravljanju drugih finomotoričnih nalog.