Izraz za prebavo v odsotnosti kisika je anaerobna razgradnja. Ta proces poteka v nekaterih mikroorganizmih, kot so bakterije in arheje, ki lahko razgradijo organsko snov brez prisotnosti kisika. Anaerobna presnova se pogosto uporablja v čistilnih napravah in obratih za proizvodnjo bioplina za pretvorbo organskih odpadkov v bioplin, mešanico metana in ogljikovega dioksida, ki se lahko uporablja kot obnovljiv vir energije.