Zdravniki običajno ne potopijo termometrov v tekočino pred uporabo. Nekateri termometri, zlasti tisti, ki se uporabljajo za merjenje telesne temperature, imajo lahko pokrov sonde ali pokrov sonde za enkratno uporabo, ki se pred uporabo odstrani. To pomaga preprečiti širjenje mikrobov in okužb. Zdravniki lahko uporabijo tudi razkužilne robčke ali druge metode za čiščenje sonde termometra pred in po vsaki uporabi.