Mišični sistem zajca je sestavljen iz približno 250 posameznih mišic, ki predstavljajo približno 40 % telesne teže živali. Kunci se zanašajo na te mišice za različne bistvene funkcije, kot so gibanje, hranjenje, nega in razmnoževanje. Vsaka mišica je sestavljena iz snopov mišičnih vlaken, ki se krčijo in sproščajo, da ustvarijo gibanje.