Končni produkt prebave beljakovin so aminokisline. Beljakovine so velike molekule, sestavljene iz verig aminokislin. Med prebavo te beljakovine razgradijo na vse manjše in manjše peptide z encimi, imenovanimi proteaze. Te peptide nato nadalje razgradijo na posamezne aminokisline drugi encimi, imenovani peptidaze. Aminokisline se nato absorbirajo v krvni obtok in jih telo uporabi za gradnjo novih beljakovin ali za druge presnovne procese.