Fagolizosom vsebuje material, ki je bil fagocitiran in je v procesu prebave. Fagolizosom je z membrano vezan organel, ki nastane s fuzijo fagosoma in lizosoma. Fagosom je majhen vezikel, ki vsebuje material, ki ga je celica fagocitirala ali zajela. Lizosom je majhen vezikel, ki vsebuje prebavne encime. Ko se fagosom in lizosom združita, se prebavni encimi v lizosomu sprostijo v fagosom in material znotraj fagosoma se razgradi na manjše molekule.